Tổng cục đã thực hiện tốt nhiệm vụ Văn phòng Ban chỉ đạo Nhà nước về điều tra cơ bản TN&MT (Đề án 47). Đã hoàn thành 6 định mức kinh tế kỹ thuật làm cơ sở pháp lý cho hoạt động thực hiện công tác quy hoạch, điều tra, khảo sát, đo đạc, lập bản đồ và nghiên cứu về biển, hải đảo thuận lợi, hiệu quả. “Với việc xúc tiến, mở rộng và chủ động tham gia các hoạt động hợp tác quốc tế, các diễn đàn quốc tế và khu vực có liên quan, vị thế của Tổng cục đã được khẳng định bước đầu với các tổ chức, diễn đàn, cơ quan quốc tế, khu vực và các quốc gia liên quan đến biển. Trong khuôn khổ đề án 80, đã thực hiện quản lý tổng hợp các hoạt động hợp tác quốc tế đến 2020”.

Phát biểu chỉ đạo Hội nghị, Bộ trưởng Phạm Khôi Nguyên khẳng định công tác hợp tác quốc tế của Tổng cục Biển và Hải đảo Việt Nam trong năm qua khá rầm rộ cả ở khu vực và quốc tế, “ba trục thành tích Tổng cục đã làm tốt  năm 2009 là công tác tổ chức, xây dựng văn bản quy phạm pháp luật và hợp tác quốc tế”, Bộ trưởng nói. Năm 2010 cần tiếp tục định hướng rõ công tác quản lý Nhà nước về biển đảo và thiết kế hệ thống quản lý này trên cơ sở hợp tác liên ngành liên Bộ, thiết lập hệ thống quản lý biển ở các địa phương. Sớm thống nhất ký kết các Thông tư liên tịch với các Bộ, ngành liên quan đến biển.

 “Xây dựng một  ngân hàng dữ liệu tổng hợp về TN&MT biển phải được coi trọng như một chiến lược nhỏ trong các nhiệm vụ của Tổng cục. Những dữ liệu này hiện nằm phân tán tại nhiều đơn vị Bộ, ngành. Nhưng rõ ràng chỉ điều tra cơ bản là không đủ. Nhiệm vụ quan trọng của Tổng cục là xây dựng Quy hoạch phát triển kinh tế xã hội biển, bám sát Chiến lược Biển, phấn đấu đến năm 2020, ngành kinh tế biển sẽ đóng góp hơn 50% GDP. Đặc biệt coi trọng xây dựng hệ thống cấp phép trên biển, như quản lý cấp phép cho thuê mặt nước biển, bởi công tác cấp phép là một bản sắc của cơ quan quản lý Nhà nước về biển đảo”, Bộ trưởng chỉ đạo.